Ķirurģijas nodaļā tiek nodrošināta gan neatliekamā palīdzība, gan plānveida ķirurģija. Plaši izmanto modernu ķirurģisko metodi - laparaskopisko ķirurģiju, tostarp laparaskopisko trūces operāciju veikšanā Ziemeļkurzemes reģionālā slimnīca ir viena no līderēm Latvijas slimnīcu vidū. Nodaļā veic vēnu, brukas, žultspūšļu, urīnpūšļu, uroloģiskās un cita veida operācijas.