Kopš 1993.gada Māris Zirnis strādā par traumatologu Ventspils slimnīcas Traumatoloģijas nodaļā. Laikā no 2009.gada līdz 2018.gadam Traumatoloģijas nodaļā notika nodaļas vadītāju rotācija, un vadītāja pienākumus periodiski pildīja arī Māris Zirnis.
Dr.Zirnis ir apguvis lielo locītavu endoprotezēšanu, un augstā kvalitātē veic ļoti sarežītas operācijas. Viens no pirmajiem Ventspils slimnīcā apguva un uzsāka veikt gūžas un ceļa locītavu operācijas.
Māris Zirnis ir apveltīts ar labām plānošanas prasmēm, tajā skaitā pievēršot uzmanību un veltot laiku savas profesionalitātes pilnveidei. Māris Zirnis ir nosvērts, zinošs un ar augstu profesionalitāti, ko apliecina arī vairākkārtēji saņemtie SIA “Ziemeļkurzemes reģionālā slimnīca” Gada ārsta tituli.